新疆伊犁河谷分布野生植物药材近千种，动物药材数10种，矿物药材数10种。植物药材主要有甘草、天山雪莲、牛蒡、紫草、新疆阿魏等。动物药材主要有鹿茸、牛黄、马宝、熊胆、刺猬等。矿物药材主要有石膏、芒硝、寒水石、自然铜等。还有如霍城县的四爪陆龟、樱桃李，巩留县的野核桃，察布查尔锡伯自治县的金黄侧金盏花以及睡莲、水菖蒲，尼勒克县的黑蜂等一些珍稀特产资源，它们共同构成了伊犁这个十分丰富的中药材资源宝库。
伊犁中药材的采收原则
根和根茎类 宜在植物生长停止、花叶萎谢的休眠期，或在春季发芽前采集。但也有例外情况，如柴胡、明党参在春天采较好，孩儿参则在夏季采集较好，延胡索立夏后地上部分枯萎，不易寻找，故多在谷雨和立夏之间采挖。
全草和叶类 应在植物生长最旺盛时，或在花蕾将开放时，或在花盛开而果实种子尚未成熟时采收。但桑叶需经霜后采收，枇杷叶、银杏叶需落地后收集。
树皮和根皮类 树皮多在春夏之交采收，含量既高，也易于剥离。根皮多在秋季采收。因为树皮、根皮的采收容易损害植物生长，所以应当注意采收方法。有些干皮的采收可结合林木采伐来进行。
花类 一般在花开放时采收。有些则于花蕾期采收，如槐米、丁香等。此外如除虫菊宜在花头半开放时采收，红花则在花冠由黄变橙红时采收为宜。
果实和种子类 果实应在已成熟或将成熟时采收，少数用未成熟的果实，如枳实，种子多应在完全成熟后采收。
众多药用植物待开发
新疆伊犁河谷的土壤因水热状况不同，垂直分布非常明显，既有高山冰川、山地草甸土、山地森林土又有山地黑土、栗钙土、棕钙土、草甸土等。且大部分地方水草充足，气候温和，日照时间长，这些独特的自然环境，为伊犁中药材的种植提供了良好的场所。
根据伊犁州药监部门和农业部门的普查，在伊犁河两岸，不管是高山草甸带，还是中低山地带点均有药用价值很高的植物分布，如：高山凤毛菊、雪莲、高山红景天等200多种药用植物，在雪岭云杉下的中低山和山前冲积平原一带，还分布着种类繁多的党参、天山野罂粟、木贼麻黄、山楂、菊芭、土木香等，有些药用植物是伊犁特有的，如伊犁贝母、新疆秦艽等，伊犁河谷中药材资源不但分布广泛，而且品种繁多，蕴藏量大。据州药监局调查，这里至少有1000多种药用植物，是新疆药用植物分布最多的区域，且部分中药材为稀有品种，极具开发价值，目前该局已着手拟定伊犁州中药材开发建议。
在伊犁中药材开发有很好的基础，伊犁州农村有许多农民早有采集、种植和加工地产中药材的历史和经验，20世纪70年代末，伊犁州中药材生产曾经有一段兴盛的历史。如霍城，巩留、伊宁县广泛种植伊犁贝母和红花。新源、巩留县不少乡镇都试种过甘草、黄芪、板兰根和柴胡。伊犁制药厂还生产过伊犁特有产品鹿角胶和雪莲酒等，生产的一些中药材不仅满足了本地的需求，还销往全国各地，直到现在，伊犁贝母雪莲、肉苁蓉、红花等仍有中药材市场上的热销货。
从市场前景看，中医草药是我国人民医疗卫生保健体系的重要组成部分，目前全世界约有80%以上的人口应用植物药进行治疗，年销售额在200亿美元以上。在我国加人WTO以后，因为知识产权问题对化学药品生产研究有较大的冲击，而传统中药却获得了良好的发展机遇，况且种植中药材的成本低，许多品种是地道的地产药材，据资料显示，仅今年前4个月，新疆中药材出口额就达到500万美元，比去年同期增长45%，出口市场增势强劲，在目前种植业朝着突出区域布局方向发展的时候，在不同的适宜区，发展种植中药材种植前景非常看好。
