和田地区文物管理所（博物馆）建立于1979年， 1981年从各县市征集文物的基础上建立了“和田文物陈列室”。从全地区150多处文物点采集、民间收集文物近1万件（其中 一级文物14件），书籍600余本。

       博物馆经地区机构编制委员会2001年5月14日会议研究，同意和田地区文物管理所增挂“和田地区博物馆”的牌子，实行一套人马两块牌子，原文物管理所性质、编制、机构规格不变。地区文物管理所充分发挥了文物陈列室的作用。通过文物介绍了和田的过去和现在，教育了广大群众，并发展了国内外旅游业。
       和田地区虽然文物古迹众多，因无收藏、展出文物的博物馆。至1995年，日本友人小岛康誉先生为新建和田博物馆捐资100万人民币，在国家计委、自治区文物局拨款资助的情况下，2001年4月和田博物馆工程正式开工。于2003年5月博物馆主体工程建筑已基本完工。和田地区博物馆原址因扩建广场被拆迁，于2003年4月17日由塔乃依南路2号搬迁至和田市北京西路342号的新博物馆。经过六年的努力，博物馆于2005年10月29日举行了开馆典礼，正式向国内外游客开放。

       和田地区博物馆总建筑面积为3400平方米，共4层，地下室是文物中心库房，面积为700平米房，一层是历史文物展览馆（一个展厅，四个小展厅，四个小展厅为专题文物展厅），面积为530平方米，二层是民俗礼仪展厅（一个展厅，四个小展厅，四个小展厅为专题文物展厅），面积为530平方米，三层是博物馆学术研究交流中心。和田博物馆是个综合性的博物馆,为“二级风险级博物馆”。